基因表達(dá)的調(diào)控
本章內(nèi)容簡(jiǎn)介
一、基因表達(dá)調(diào)控的基本概念與原理
二、乳糖操縱子的調(diào)控模式
三、色氨酸操縱子的調(diào)控模式
一、基因表達(dá)調(diào)控的基本概念與原理
1.基本概念:
基因表達(dá)(gene expression):從DNA到蛋白質(zhì)的過(guò)程稱為基因表達(dá),基因表達(dá)的實(shí)質(zhì)就是遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯。
基因表達(dá)的調(diào)控(gene regulation or genecontrol) :對(duì)基因表達(dá)過(guò)程的調(diào)節(jié)就稱為基因表達(dá)調(diào)控。
2.基因表達(dá)的時(shí)間性及空間性
基因表達(dá)的時(shí)間特異性(temporalspecificity)是指特定基因的表達(dá)嚴(yán)格按照特定的時(shí)間順序發(fā)生,以適應(yīng)細(xì)胞或個(gè)體特定分化、發(fā)育階段的需要。故又稱為階段特異性。
基因表達(dá)的空間特異性(spatialspecificity)是指多細(xì)胞生物個(gè)體在某一特定生長(zhǎng)發(fā)育階段,同一基因的表達(dá)在不同的細(xì)胞或組織器官不同,從而導(dǎo)致特異性的蛋白質(zhì)分布于不同的細(xì)胞或組織器官。故又稱為細(xì)胞特異性或組織特異性。
3.基因表達(dá)的方式
組成性基因表達(dá)(constitutive geneexpression)是指在個(gè)體發(fā)育的任一階段都能在大多數(shù)細(xì)胞中持續(xù)進(jìn)行的基因表達(dá)。其基因表達(dá)產(chǎn)物通常是對(duì)生命過(guò)程必需的或必不可少的,且較少受環(huán)境因素的影響。這類基因通常被稱為管家基因(housekeepinggene)。
誘導(dǎo)表達(dá)(induction)是指在特定環(huán)境因素刺激下,基因被激活,從而使基因的表達(dá)產(chǎn)物增加。這類基因稱為可誘導(dǎo)基因。
阻遏表達(dá)(repression)是指在特定環(huán)境因素刺激下,基因被抑制,從而使基因的表達(dá)產(chǎn)物減少。這類基因稱為可阻遏基因。
基因表達(dá)的生物學(xué)意義
(一)適應(yīng)環(huán)境、維持生長(zhǎng)和增殖。
(二)維持個(gè)體發(fā)育與分化。
4. 基因表達(dá)調(diào)控主要表現(xiàn)方面
4.1轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptional regulation)
4.2轉(zhuǎn)錄水平后的調(diào)控(post-transcriptional regulation)
1)mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(differentialprocessing of RNA transcript)
2)翻譯水平上的調(diào)控(differentialtranslation of mRNA)
原核生物基因表達(dá)的調(diào)控主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平
真核生物基因表達(dá)的調(diào)控可發(fā)生在基因表達(dá)的各個(gè)水平
4.3 其它影響因素
原核生物中,營(yíng)養(yǎng)狀況(nutritionalstatus)和環(huán)境因素(environmentalfactor)對(duì)基因表達(dá)起著舉足輕重的影響。
在真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平(hormonelevel)和發(fā)育階段(developmentalstage)是基因表達(dá)調(diào)控的最主要手段,營(yíng)養(yǎng)和環(huán)境因素的影響力大為下降。
5.基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素:
5.1順式作用元件:
順式作用元件(cis-actingelement)又稱分子內(nèi)作用元件,指存在于DNA分子上的一些與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)的特殊順序。
在原核生物中,大多數(shù)基因表達(dá)通過(guò)操縱子模型進(jìn)行調(diào)控,其順式作用元件主要由啟動(dòng)基因、操縱基因和調(diào)節(jié)基因組成。
在真核生物中,與基因表達(dá)調(diào)控有關(guān)的順式作用元件主要有啟動(dòng)子(promoter)、增強(qiáng)子(enhancer)和沉默子(silencer)。
5.2反式作用因子:
反式作用因子(trans-actingfactor)又稱為分子間作用因子,指一些與基因表達(dá)調(diào)控有關(guān)的蛋白質(zhì)因子。
原核生物中的反式作用因子主要分為特異因子、激活蛋白和阻遏蛋白;而真核生物中的反式作用因子通常稱為轉(zhuǎn)錄因子。
5.3順式作用元件與反式作用因子的相互作用:
大多數(shù)調(diào)節(jié)蛋白在與DNA結(jié)合之前,需先通過(guò)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,形成二聚體或多聚體,然后再通過(guò)識(shí)別特定的順式作用元件,而與DNA分子結(jié)合。這種結(jié)合通常是非共價(jià)鍵結(jié)合。
Ⅰ原核生物轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控
1操縱子
2弱化子 (衰減子)
3降解物
4應(yīng)急反應(yīng)
Ⅱ原核生物的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控
1. 操縱子的調(diào)控模式
1.1 基本概述
1.2 乳糖操縱子的調(diào)控模式
1.3 色氨酸操縱子的調(diào)控模式
1.4 其他操縱子的調(diào)控機(jī)制
1.1 操縱子概述
提出:法國(guó)Jacob與Monod(1961年)
概念
操縱子(operon):指的是一組功能上相關(guān)的基因,它是由啟動(dòng)區(qū)(promoter)、操縱區(qū)(operator)和結(jié)構(gòu)基因(structuralgene)三部分組成。
所謂的操縱子理論是認(rèn)為在DNA分子上分布有調(diào)節(jié)基因、啟動(dòng)子、操縱區(qū)和一群功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因區(qū)。
乳糖操縱元
典型的操縱子可分為控制區(qū)和信息區(qū)兩部分??刂茀^(qū)由各種調(diào)控基因所組成,而信息區(qū)則由若干結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起構(gòu)成。
概念
結(jié)構(gòu)基因(structuralgene):編碼蛋白質(zhì)的基因。
操縱區(qū)(operator):是指能被調(diào)控蛋白特異性結(jié)合的一段DNA序列,常與啟動(dòng)子鄰近或與啟動(dòng)子序列重疊,當(dāng)調(diào)控蛋白結(jié)合在操縱子序列上,會(huì)影響其下游基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)弱。
調(diào)控基因(regulatorygene):是編碼能與操縱序列結(jié)合的調(diào)控蛋白的基因。
與操縱子結(jié)合后能減弱或阻止其調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白稱為阻遏蛋白(repressiveprotein),其介導(dǎo)的調(diào)控方式稱為負(fù)性調(diào)控(negativeregulation);
與操縱子結(jié)合后能增強(qiáng)或啟動(dòng)其調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白稱為激活蛋白(activatingprotein),所介導(dǎo)的調(diào)控方式稱為正性調(diào)控(positiveregulation)。
1.2乳糖操縱子的調(diào)控模式
乳糖操縱子(lactoseoperon)的組成
lac 體系受調(diào)控的證據(jù)
乳糖操縱子的調(diào)控
乳糖對(duì)lac 體系的影響
葡萄糖對(duì)lac 體系的影響
CAP & cAMP
lac體系受調(diào)控的證據(jù)
乳糖添加實(shí)驗(yàn)
同位素示蹤
乳糖操縱子的本底水平表達(dá)
在非誘導(dǎo)狀態(tài)下有少量的lacmRNA合成(大約每個(gè)世代中有1~5個(gè)mRNA分子),這種合成被稱之為本底水平的永久型合成(backgroundlevel constitutivesynthesis)。由于阻遏物的結(jié)合并不是絕對(duì)緊密的,即使在它與操縱基因緊密結(jié)合時(shí),也會(huì)偶爾掉下來(lái);這時(shí)啟動(dòng)子的障礙被解除,RNA聚合酶開(kāi)始轉(zhuǎn)錄。
乳糖操縱子的調(diào)控
乳糖操縱子的阻遏:
B. 葡萄糖對(duì)lac操縱子的影響
C.CAP與CAP結(jié)合位點(diǎn)
CAP的通用名稱:分解代謝基因激活蛋白(catabolicgene activator protein)
含有CAP結(jié)合位點(diǎn)的操縱子:乳糖操縱元(lacoperon)、阿拉伯糖操縱元(araoperon)、半乳糖操縱元(galoperon)(見(jiàn)課本206頁(yè))
CAP也起類似的正性調(diào)控作用。
lac操縱子DNA的調(diào)控區(qū)域(P、O區(qū))
氨基酸合成的操縱子
1.3 色氨酸操縱子(tryptophaneoperon)的調(diào)控模式
屬于一種負(fù)性調(diào)控的、可阻遏的操縱子(repressibleoperon),即這操縱子通常是開(kāi)放轉(zhuǎn)錄的,有效應(yīng)物(色氨酸為阻遏劑)作用時(shí)則阻遏關(guān)閉轉(zhuǎn)錄。
不受葡萄糖或cAMP-CAP的調(diào)控。
1.3 色氨酸操縱子的調(diào)控模式
Atrp操縱子的組成
Btrp操縱子的阻遏系統(tǒng)
C衰減子及其作用
D 前導(dǎo)肽
Etrp操縱子的弱化機(jī)制
trp操縱子的阻遏系統(tǒng)
衰減子及其作用
弱化作用(attenuation):當(dāng)色氨酸達(dá)到一定濃度、但還沒(méi)有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時(shí),產(chǎn)生色氨酸合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產(chǎn)生的酶量與色氨酸濃度呈負(fù)相關(guān)。
先導(dǎo)序列起到隨色氨酸濃度升高降低轉(zhuǎn)錄的作用,這段序列就稱為衰減子或弱化子(attenuator)。
在trp操縱元中,對(duì)結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控起到粗調(diào)的作用,而衰減子起到細(xì)調(diào)的作用。
前導(dǎo)肽
見(jiàn)課本213頁(yè)
色氨酸濃度低
——trp操縱元就處于開(kāi)放狀態(tài)
色氨酸濃度增高
——轉(zhuǎn)錄減弱
Trp 操縱子小結(jié)
1.4 其它操縱子的調(diào)控機(jī)制
半乳糖操縱子(galactose operon)
阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon)
半乳糖操縱子(galactose operon)
包括3個(gè)結(jié)構(gòu)基因:
異構(gòu)酶(UDP-galactose-4epimerase,galE)
半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galactosetransferase, galT),
半乳糖激酶(galactose kinase,galk)
特點(diǎn):
有兩個(gè)啟動(dòng)子,其mRNA可從兩個(gè)不同的起始點(diǎn)開(kāi)始轉(zhuǎn)錄
有兩個(gè)O區(qū),一個(gè)在P區(qū)上游-67--53,另一個(gè)在結(jié)構(gòu)基因galE內(nèi)部
阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon)
阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon),在葡萄糖饋乏時(shí),它能利用阿拉伯糖作為能源。
阿拉伯糖操縱子由araB,araA及araD基因組成。
II.轉(zhuǎn)錄后調(diào)控 (見(jiàn)課本)
翻譯起始的調(diào)控
稀有密碼子對(duì)翻譯的影響
重疊基因?qū)Ψg的影響
RNA高級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)翻譯的影響
魔斑核苷酸水平對(duì)翻譯的影響
本章掌握重點(diǎn)內(nèi)容
基因表達(dá)調(diào)控的概念、特點(diǎn)和基本原理。
乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)及其組遏蛋白的負(fù)性調(diào)控和CAP正性調(diào)控機(jī)理。
色氨酸操縱子的轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制。
基本概念:
基因表達(dá)激活蛋白組遏蛋白順式作用元件反式作用因子操縱基因衰減子
選擇題:
1. Lac操縱子的誘導(dǎo)劑是B
A.葡萄糖B.別乳糖C.阿拉伯糖O.絲氨酸 E.色氨酸
. Ara操縱子的誘導(dǎo)劑是
2就當(dāng)前認(rèn)識(shí),基因表達(dá)調(diào)控最主要的環(huán)節(jié)是:
A、DNA復(fù)制B、RNA轉(zhuǎn)錄激活C、RNA轉(zhuǎn)錄后加工
D、RNA轉(zhuǎn)錄后轉(zhuǎn)運(yùn)E 、翻譯及翻譯后加工
(北京醫(yī)科大學(xué)1999年生化)
3.對(duì)自身基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄調(diào)控的特異DNA序列是
A.順式作用因子B.反式作用因子
C.順式作用元件D.反式作用元件
4.由某一基因表達(dá)后,對(duì)另一基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄調(diào)控的因子是
3.如果操縱子的基因突變?nèi)笔?/b>
A、操縱子將不被轉(zhuǎn)錄B、操縱子將繼續(xù)被轉(zhuǎn)錄
C、操縱子的阻遏蛋白將繼續(xù)合成D、將無(wú)誘導(dǎo)物E、以上都不是
是非題
調(diào)節(jié)基因一般都位于operon附近,這種構(gòu)造有利于調(diào)節(jié)基因?qū)?/b>operon的控制.()
(中科院上海生化所2001)
填空題:
操縱子包括_______,__________和__________.
(北師大1999)
選擇題
分解代謝基因活化蛋白(CAP)對(duì)乳糖操縱子表達(dá)是
A正性調(diào)控B正、負(fù)性調(diào)控C負(fù)性調(diào)控
D無(wú)調(diào)控作用E可有可無(wú)(1995年北醫(yī)試題)
簡(jiǎn)答題:
簡(jiǎn)述乳糖操縱子的正、負(fù)調(diào)控(2002年中國(guó)農(nóng)科院)
什么是正調(diào)控與負(fù)調(diào)控,試舉例說(shuō)明。(1996年中國(guó)農(nóng)科院)
以乳糖操縱子為例說(shuō)明什么是基因的表達(dá)與阻遏?(8分)(1997第四軍醫(yī)大學(xué))
選擇題
下列哪個(gè)操縱元中沒(méi)有衰減子序列?
A trp操縱元
B lac操縱元
C his操縱元
D thr操縱元
是非題:
細(xì)菌中衰減子的作用方式是用翻譯的手段來(lái)控制轉(zhuǎn)錄.()
思考:
細(xì)菌的Trp操縱子中為什么除需要阻遏體系外還需要弱化子系統(tǒng)?
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